Les 10 meilleurs logiciels de comptabilité

Les logiciels de comptabilité sont de plus en plus nombreux sur le marché, ils aident véritablement les entrepreneurs en leur faisant gagner du temps.

Comparez et trouvez le meilleur logiciel qui vous permettra de faire votre comptabilité facilement.

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Logiciel De Comptabilité

Pennylane

Pennylane

Pennylane s'impose comme une solution tout-en-un particulièrement appréciée des startups et PME en croissance. La plateforme centralise la comptabilité, la facturation, les notes de frais et même la gestion de trésorerie dans une interface moderne et ergonomique. Son point fort réside dans l'automatisation poussée : la synchronisation bancaire permet de catégoriser automatiquement les transactions, réduisant considérablement le temps de saisie manuelle.

Les tarifs démarrent autour de 25€ par mois pour les profils indépendants, avec des formules évolutives incluant la gestion multi-entités pour les holdings. Pennylane se distingue par sa capacité à gérer les opérations complexes comme les immobilisations, les écritures de TVA intracommunautaire ou encore les provisions. L'outil facilite aussi la collaboration avec l'expert-comptable grâce au partage d'accès sécurisé et à l'export FEC normalisé.

L'application mobile permet de scanner les justificatifs et de suivre sa trésorerie en déplacement. La déclaration de TVA est simplifiée avec un pré-remplissage automatique des formulaires. Pennylane propose également un module de pilotage financier avec tableaux de bord personnalisables, parfait pour les dirigeants souhaitant analyser leurs performances en temps réel sans compétences comptables avancées.

Axonaut

Axonaut

Axonaut se positionne comme un CRM comptable hybride, idéal pour les TPE et artisans cherchant à centraliser relation client et gestion financière. Au-delà de la comptabilité classique, l'outil intègre la prospection commerciale, le suivi des devis et la gestion de projets. Cette approche globale séduit les entrepreneurs qui veulent éviter de jongler entre plusieurs logiciels.

Les fonctionnalités comptables incluent la facturation conforme, le rapprochement bancaire automatique et la génération des documents fiscaux essentiels. Les tarifs commencent à partir de 40€ par mois, positionnant Axonaut sur un segment premium justifié par sa polyvalence. L'interface est pensée pour les non-comptables, avec des libellés clairs et des assistants de saisie qui guident l'utilisateur étape par étape.

Le module de gestion commerciale permet de transformer un devis en facture en un clic, puis d'intégrer automatiquement l'écriture comptable correspondante. La synchronisation avec les banques françaises facilite le suivi de trésorerie quotidien. Axonaut propose aussi des fonctionnalités avancées comme la gestion des acomptes, des avoirs et des relances clients automatiques, un gain de temps précieux pour les entrepreneurs débordés.

Indy

Indy

Indy est un logiciel de comptabilité très utilisé par les indépendants.

Il permet de prendre en charge un grand nombre de tâches administratives, permettant aux freelances et aux petites entreprises de se concentrer sur des tâches plus importantes.

Parmi tous ses concurrents, la plateforme s'est différenciée en rendant une grande partie de son offre gratuite. Toutefois, il faut préciser que certaines fonctionnalités disponibles avec Indy sont bien payantes, comme la partie déclarative qui est obligatoire pour les entreprises.

La création de factures étant très réglementée en France, cela permet à tous les professionnels de générer des documents qui répondent bien aux normes en vigueur en France.

Indy est aussi une plateforme plébiscitée pour son compte bancaire pour les entrepreneurs, qui vise à concurrencer les banques en ligne à destination des professionnels.

Tout cela fait d'Indy l'un des logiciels comptables tout-en-un les plus complets du moment !

Sage 50

Sage 50

Sage 50 représente la référence historique pour les PME recherchant une comptabilité robuste et conforme aux normes les plus strictes. Ce logiciel installé en local (avec option cloud) convient particulièrement aux structures ayant des besoins comptables complexes : gestion analytique multi-axes, consolidation de plusieurs entités ou comptabilité d'engagement. Son interface, bien que moins moderne que les pure players en ligne, inspire confiance par sa stabilité éprouvée.

Les tarifs se situent autour de 50€ par mois en version standard, avec des coûts additionnels pour les modules avancés comme la gestion des immobilisations ou la comptabilité budgétaire. Sage 50 excelle dans le traitement de volumes importants d'écritures et offre des possibilités de paramétrage quasi infinies. Les experts-comptables apprécient particulièrement sa compatibilité avec les outils professionnels du cabinet.

Le logiciel intègre tous les états réglementaires : bilan, compte de résultat, liasse fiscale, déclarations de TVA et DEB/DES pour les échanges intracommunautaires. La fonction de lettrage automatique et le rapprochement bancaire multi-comptes font gagner un temps considérable. Sage propose aussi un accompagnement technique solide avec formation et hotline, essentiel pour maîtriser toutes les subtilités du logiciel.

Tiime

Tiime

Tiime cible spécifiquement les indépendants et micro-entrepreneurs avec une solution simplifiée accessible dès 9,90€ par mois. L'outil a été conçu pour les profils sans connaissances comptables, proposant une expérience utilisateur fluide et des automatisations intelligentes. La synchronisation bancaire associée à l'intelligence artificielle permet de catégoriser automatiquement les dépenses professionnelles et personnelles.

Le tableau de bord affiche en temps réel le chiffre d'affaires, les charges déductibles et les échéances fiscales à venir. Tiime génère automatiquement les déclarations d'impôts et de cotisations sociales pour les auto-entrepreneurs, un véritable plus face à la complexité administrative française. L'application mobile facilite la numérisation des justificatifs via simple photo, avec reconnaissance automatique des informations.

Les formules supérieures incluent l'accompagnement par un expert-comptable partenaire dès 49€ par mois, combinant autonomie logicielle et conseil personnalisé. Tiime propose aussi la création de devis et factures conformes, le suivi des paiements clients et l'envoi de relances automatiques. L'outil calcule en temps réel le montant disponible après prélèvements fiscaux et sociaux, aidant les indépendants à mieux gérer leur trésorerie personnelle.

Cegid comptabilité

Cegid Comptabilité

Cegid s'adresse aux cabinets d'expertise comptable et aux moyennes entreprises exigeant une solution professionnelle de haut niveau. Cette suite logicielle couvre l'intégralité du cycle comptable et fiscal, de la saisie aux déclarations en passant par la révision et le contrôle. L'écosystème Cegid permet d'interconnecter comptabilité, paie, gestion commerciale et tableaux de bord décisionnels.

Les tarifs sont généralement communiqués sur devis, reflétant la personnalisation possible selon la taille de structure et les modules souscrits. Cegid Loop, la version cloud moderne, facilite le travail collaboratif entre l'entreprise et son expert-comptable avec partage de documents sécurisé et workflow de validation. La plateforme intègre des contrôles de cohérence avancés détectant automatiquement les anomalies comptables.

Abby

Abby

Abby révolutionne la comptabilité des auto-entrepreneurs avec une approche 100% mobile et conversationnelle. Accessible dès 12€ par mois, l'application transforme la gestion comptable en une expérience simple où l'utilisateur échange par messages avec son assistant virtuel. Il suffit de photographier une facture ou un ticket pour que le système l'intègre automatiquement dans la comptabilité.

L'intelligence artificielle catégorise les dépenses, calcule les charges sociales et fiscales en temps réel, et alerte sur les échéances importantes. Abby génère automatiquement les déclarations de chiffre d'affaires mensuelles ou trimestrielles, préremplies et prêtes à transmettre à l'URSSAF. L'outil suit également l'avancement des plafonds de chiffre d'affaires pour éviter les dépassements de seuils.

La fonction compte professionnel intégré permet de séparer automatiquement les flux personnels et professionnels, simplifiant drastiquement la comptabilité. Abby calcule en direct le revenu disponible après impôts et cotisations, aidant les indépendants à mieux piloter leur trésorerie. Les formules premium incluent l'accès à des experts-comptables par chat pour répondre aux questions ponctuelles. L'application propose aussi des conseils personnalisés d'optimisation fiscale.

Sellsy

Sellsy

Sellsy combine CRM, facturation et comptabilité dans une plateforme tout-en-un particulièrement adaptée aux entreprises de services et agences. Les tarifs démarrent autour de 37€ par mois pour la formule incluant les fonctionnalités comptables de base. L'outil brille par sa capacité à automatiser l'ensemble du cycle commercial : du lead à la facturation puis à l'écriture comptable.

La synchronisation bancaire intelligente permet de rapprocher automatiquement les paiements reçus avec les factures émises. Sellsy génère les états financiers essentiels (balance, grand livre, journaux) et facilite la transmission des données à l'expert-comptable via export FEC. L'interface intuitive affiche des tableaux de bord visuels avec indicateurs de performance financière en temps réel.

Le module de gestion de trésorerie permet d'anticiper les besoins grâce à des prévisions basées sur les factures en attente et les charges récurrentes. Sellsy propose aussi la gestion des notes de frais avec validation hiérarchique et intégration comptable automatique. Les fonctionnalités de facturation incluent les devis, acomptes, factures d'acompte et avoir, avec personnalisation graphique complète. L'outil s'adapte aussi bien aux TPE qu'aux structures de 50 collaborateurs.

Freebe

Freebe

Freebe s'impose comme le logiciel des freelances créatifs et consultants avec une interface épurée et moderne. Accessible dès 9€ par mois, l'outil couvre facturation, comptabilité simplifiée et suivi de trésorerie dans une approche minimaliste mais efficace. La plateforme automatise la catégorisation des transactions bancaires et calcule en temps réel les charges fiscales et sociales à provisionner.

La force de Freebe réside dans sa simplicité d'utilisation : aucune connaissance comptable n'est requise pour générer ses déclarations de TVA ou suivre sa rentabilité. L'outil propose des modèles de factures élégants personnalisables, conformes aux obligations légales françaises. Le suivi des paiements clients est facilité par des alertes automatiques et l'envoi de relances personnalisables.

Freebe intègre un tableau de bord financier visuel affichant le chiffre d'affaires mensuel, les dépenses catégorisées et la trésorerie disponible après impôts. L'application mobile permet de scanner les reçus en déplacement et de créer des factures depuis son smartphone. Les formules premium incluent la synchronisation multi-banques, la gestion de projets et le suivi du temps passé. L'outil propose aussi des rapports d'activité exportables pour faciliter les échanges avec l'expert-comptable.

Ma compta

Ma Compta

Ma compta se distingue comme une solution économique pour les très petites entreprises et indépendants souhaitant limiter leurs coûts. Les tarifs commencent à environ 6€ par mois pour les fonctionnalités de base, positionnant l'outil parmi les plus accessibles du marché. L'interface volontairement simple permet une prise en main rapide même pour les utilisateurs sans aucune formation comptable.

Le logiciel couvre les essentiels : facturation conforme, suivi des encaissements et dépenses, rapprochement bancaire manuel, et génération des documents fiscaux de base. Ma compta propose des modèles de factures légaux et la gestion des devis avec transformation en facture. L'outil calcule automatiquement la TVA collectée et déductible, facilitant les déclarations CA3 et CA12.

Bien que moins sophistiqué que ses concurrents premium, Ma compta répond parfaitement aux besoins des micro-entreprises avec une activité simple : prestations de services, commerce de détail ou artisanat traditionnel. Le support client par email et les tutoriels vidéo accompagnent les premiers pas. L'export comptable au format standard permet de transmettre facilement les données à un expert-comptable externe. Les formules supérieures ajoutent la synchronisation bancaire et des fonctionnalités de gestion commerciale basiques.

🧾 Qu'est ce qu'un logiciel de comptabilité ?

🛠️ Fonctionnalité 👥 Nombre d'utilisateurs
💻 Automatisation Gain de temps
🔒 Sécurité Protection des données sensibles
💰 Coût abordable Accessible
📊 Gestion simplifiée Centralisation des opérations comptables
📈 Suivi des performances Analyse facile des finances

Même si un logiciel de comptabilité n'est pas toujours obligatoire, cette solution comporte beaucoup d’avantages en termes de sécurité et de gain de temps.

L’alternative reste la collaboration avec un expert-comptable. Un bon compromis consiste à réaliser la pré-comptabilité à l’aide d’un logiciel, et de confier la réalisation du bilan comptable à votre expert-comptable.

Le processus comptable consiste en une série d’opérations, parmi lesquelles l’édition de devis ou de factures, et qui s’achève par la production d’un bilan comptable, d’un compte de résultat et d’une annexe générale.

Un logiciel de comptabilité apporte une solution logicielle à cette problématique, en automatisant un certain nombre de tâches dans une interface où chaque élément trouve sa place.

🧐 Comment bien choisir un logiciel de comptabilité ?

⚙️ Fonctionnalité 🗒️ Description
🧾 Génération de documents Création et personnalisation des documents commerciaux
💸 Gestion des dépenses et recettes Suivi des flux financiers de l'entreprise
📑 Export des écritures comptables Transmission des données comptables à l'expert-comptable
💻 Accès hors ligne Possibilité de travailler sans connexion internet
💬 Messagerie et alertes Notifications pour les échéances importantes et communication intégrée

La gestion commerciale et la facturation sont ce que l’on attend avant tout d’un logiciel de comptabilité.

Lorsque celui-ci est couplé à un CRM, les devis et factures sont automatisés, et vous pouvez même, dans certains cas, suivre vos stocks.

Vous tenez votre comptabilité et transmettez vos données à un expert-comptable, qui réalisera votre bilan comptable, votre compte de résultat et votre annexe générale facilement, grâce aux données que vous lui aurez transmises au fur et à mesure.

Voici les fonctionnalités d'un logiciel de comptabilité qui sont généralement attendues :

  • édition de devis ;
  • synthèse des ventes;
  • édition de factures d’achat et de vente ;
  • visualisation des dépenses et recettes ;
  • enregistrement des notes de frais;
  • export des écritures comptables ;
  • plan comptable ;
  • accès hors ligne ;
  • possibilité d’import et d’export comptable ;
  • messagerie et alertes ;
  • établissement de déclaration fiscale;
  • édition de journaux ;
  • synchronisation bancaire;
  • trésorerie prévisionnelle.

D’autres fonctionnalités sont spécifiques à certains logiciels :

  • saisie manuelle dans un journal ;
  • saisie des frais kilométriques;
  • édition des fiches de paie;
  • génération de la DNS;
  • suivi et relance des factures impayées;
  • avoirs et des bons de livraison;
  • automatisation de la TVA ;
  • stocks ;
  • intégration des relevés de banque ;
  • récupération automatique des factures d’achat ;
  • attachement de justificatifs ;
  • lettrage des débits et crédits.

Les paiements par l’intermédiaire de plateformes dématérialisées, quand ils sont proposés, permettent de régler des factures, et d’intégrer directement ces mouvements à votre comptabilité.

Les lettrages et le rapprochement bancaire sont ainsi automatisés pour des échanges totalement sécurisés.

Pour les structures qui font leur comptabilité de bout en bout, il est important de pouvoir gérer les opérations suivantes :

  • édition du bilan comptable ;
  • grand livre;
  • comptabilité analytique;
  • balance analytique;
  • déclaration de TVA ;
  • édition du compte de résultat ;
  • édition des livres comptables.

📜 Statut juridique

C’est le statut juridique de votre entreprise qui conditionne les opérations comptables que vous serez dans l’obligation de réaliser.

C’est pourquoi certains logiciels sont dédiés aux autoentrepreneurs ou aux associations : leurs statuts juridiques sont moins contraignants que les SAS ou les SARL, et encore moins que ceux des SA.

Veillez donc à choisir un logiciel calibré pour le statut juridique de votre entreprise.

À noter : il faut savoir que le régime d’imposition auquel vous êtes soumis conditionne souvent votre type de comptabilité. Une comptabilité de trésorerie fonctionne grâce aux flux bancaires, et est grandement facilitée par un outil de synchronisation bancaire. Ce n’est pas le cas pour une comptabilité d’engagement, qui repose sur la gestion des factures.

🏢 Taille de l'entreprise

Suivant la taille et l’organigramme de votre entreprise, la prise en charge de votre comptabilité sera plus ou moins complexe.

Si vous disposez d’un expert-comptable, voire d’un service comptabilité, la réalisation de ces exercices ne sera pas à la charge du chef d’entreprise, par exemple.

Votre masse salariale va peser sur la gestion des notes de frais. Si les limites d’usage de votre logiciel sont dépassées, le tarif de votre abonnement peut grimper : ces éléments sont à prendre en considération en amont, et il peut être bien, dès le départ, d’anticiper la croissance de votre structure.

Attention
Une ETI ou une grande entreprise pourra avoir besoin de solutions spécifiques que tous les logiciels ne pourront pas apporter : il faudra se tourner vers des formules haut de gamme (Selfmed, Ipaidthat ou EBP par exemple).

👥 Nombres d'utilisateurs

Certains logiciels autorisent un nombre d’utilisateurs illimité (Sinao, Sage), d’autres un nombre limité (iTool,Tiime).

Ces utilisateurs peuvent bénéficier d’un accès :

  • par tâche ;
  • par poste ;
  • par domaine d’activité.

Il faut créer et personnaliser les comptes de chaque utilisateur.

Les tiers auxiliaires auront accès uniquement aux modules nécessaires à leur activité. Il est même possible de créer des accès en lecture seule sur certains logiciels.

🛠️ Secteur d'activité

En fonction de votre secteur d'activité (e-commerce, restaurant, BTP ...), vos besoins ne seront pas le mêmes.

À chaque secteur correspond un type d’outil spécifique : logiciel CRM, connexion à un logiciel de caisse, suivi de chantier, etc.

💻 Type de logiciel

Vous pouvez opter pour un logiciel en ligne (SAAS), un logiciel à télécharger ou un ERP. Mais quelles sont les différences ?

Les SaaS

Saas De Comptabilité

Les Saas se développent en nombre depuis une dizaine d’années. Ils sont généralement lancés par des start-up.

Ils sont accessibles en ligne, via votre navigateur internet ou une application. Vous pouvez y avoir accès depuis n'importe quel ordinateur, en utilisant votre nom d'utilisateur et votre mot de passe.

Ils sont simples, ergonomiques, ont des mises à jour automatiques et permettent facilement de générer des devis, des factures, de suivre les encours ou encore de déclarer la TVA.

Les logiciels à installer

Logiciel à Télécharger De Comptabilité

Contrairement à un SAAS, un logiciel à installer est beaucoup plus contraignant, surtout si vous êtes indépendant.

Il faudra en effet réaliser sa comptabilité sur un ordinateur fixe, après avoir installer le logiciel de comptabilité.

Les ERP

Erp Comptabilité

Les ERP sont aussi appelés progiciels de gestion intégrée. Ils sont constitués de modules qui couvrent chacun un aspect de la gestion entrepreneuriale, comme la comptabilité, le CRM, le marketing ou la logistique.

Ils sont plus complexes, mais plus complets et offrent une visibilité à 360°.

Ces solutions s’adressent plutôt aux ETI ou aux GA : une gestion globale est nécessaire dans une entreprise dont le niveau de développement est conséquent. C’est le cas du logiciel EBP, qui propose trois formules.

💰 Budget

Avec des tarifs mensuels qui varient de 0 à plusieurs centaines d'euros par mois, il faut adapter votre recherche à votre budget.

Cependant, il est conseillé d’étudier le détail des prestations, car time is money et il vous faut estimer le temps que vous fera gagner tel ou tel logiciel.

Un logiciel de comptabilité doit vous faire gagner du temps, c’est l’une de ses promesses. Combien de temps vous fait-il gagner ? Combien vaut votre temps ? En répondant à ces questions, vous pourrez estimer la valeur de ce logiciel et le comparer à d’autres, en pensant au long terme, à votre développement et aux options proposées.

Enfin, n’oubliez pas que la plupart des logiciels proposent des essais gratuits et même des versions gratuites. Et si vous sautez le pas, vous pouvez souvent choisir entre différents abonnements.

💼 Accompagnement d'un expert comptable

Accompagnement D'un Expert Comptable

Beaucoup de logiciels présentés dans notre classement peuvent être utilisé en association avec votre expert comptable.

En donnant un accès à votre expert comptable classique ou expert comptable à distance, il pourra lui même récupérer les lignes nécessaire pour établir votre comptabilité et votre bilan.

De plus en plus, les cabinets d'expertises comptables mettent à disposition des logiciels à leur clients.

🧾 Facturation et devis

La plupart intègre une solution pour établir des devis et des factures. Chez 100 Jours pour Entreprendre, on pense même que c'est une option indispensable pour respecter la législation.

🎯 L’ergonomie

Les chefs d’entreprise qui sont à la recherche du meilleur logiciel de comptabilité veulent généralement que son utilisation soit simple : ils ne sont pas experts-comptables.

Certains offrent une formation permettant d’appréhender leur interface, mais celle-ci peut avoir un coût.

Simple ou complexe, un logiciel de comptabilité se doit d’être ergonomique, et pour vous faire une idée, vous pouvez vous inscrire aux versions d’essai proposées par les éditeurs.

📊 L'importance de comparez les logiciels de comptabilité

L'importance De Comparez Les Logiciels De Comptabilité

Comparer pour trouver les meilleurs logiciels de comptabilité est essentiel pour choisir celui qui correspond le mieux à vos besoins.

Chaque logiciel offre des fonctionnalités, une ergonomie, et des tarifs différents qui peuvent grandement influencer votre gestion comptable.

En prenant en compte plusieurs critères, vous pouvez identifier le logiciel qui allie le mieux efficacité, facilité d'utilisation, et coût, tout en garantissant une conformité aux normes légales.